隨著我國經濟體制改革在衛生部分的深進，醫院在經營過程中的不確定因素增多，高新技術加快發展，客觀條件要求國有大中型醫院執行全面預算治理。全面預算治理是醫院財務治理的基礎和重要組成部分，通過全面預算治理，調控醫院的各項醫療資源，適應社會發展的需求，提升醫院的著名度，是醫院治理在新形勢下的必然選擇。
一、對醫院實行全面預算治理的熟悉
1、全面預算治理作為對現代企業成熟與發展起過重大推動作用的治理系統，是企業內部治理控制的一種重要方法。全面預算治理從最初的計劃、協調，發展到現在的兼具控制、激勵、評價等諸多功能的一種綜合貫徹企業經營戰略的治理工具，全面預算治理在企業內部控制中日益發揮核心作用。
2、醫院是以保障人民群眾身體健康為首要目標的公益性事業單位，但是醫療市場逐漸開放，醫院面臨著越來越大的競爭壓力，公立醫院尤其是地市級以下醫院從財政渠道獲取的補償資金遠遠滿足不了醫院發展的需要，醫院往往需要通過一定程度的自負盈虧來保證醫院的生存與發展。醫院在執行國家醫療收費政策的條件下如何降低整體運行本錢、降低病人醫藥用度負擔就日益顯得重要起來，而全面預算治理制度就成為醫院治理的一個選擇和鑒戒。
全面預算治理的主要內容包括業務預算、資本預算（投資性預算）、籌資預算和財務預算，醫院在對自身業務情況進行充分調查與評估的基礎上編列業務預算，以業務預算為出發點，編列相應的資本預算、籌資預算并終極形成財務預算，用以指導醫院日常的經營治理活動，這樣就把醫院自身的發展戰略目標和規劃予以量化，將醫院有限的資源圍繞醫院業務發展這條主線有目的、有計劃的進行投放，從而避免以往盲目追求高、新、尖，盲目擴大建設規模的錯誤傾向，進步醫院資源利用率。
3、預算治理是經營治理的一種方法和工具，預算治理不是萬能藥。預算治理必須與其他治理方法和手段相結合，同時對預算工作中出現的偏差與疏漏要及時予以糾正，這樣才有利于預算治理發揮出更好的作用。
二、醫院全面預算治理存在的題目
近幾年來，醫療衛生領域越來越多地應用高科技成果改善診治手段，并且衛生部分所需物資的價格迅速上漲，醫療衛生耗費逐年大幅度上升。隨著國家經濟體制改革進一步深進，對醫院的補助有減無增，醫院不可避免地被推向市場。在這種情況下，醫院只有通過實行科學的治理，才能在激烈的市場競爭中求得生存和發展。但在實際工作中，醫院的全面預算治理往往存在以下幾個題目：
第一，目前大多數醫院在編制年度預算時，只是財務部分按財政下發預算編制要求，結合上年財務數據按一定增減比例來編，僅僅只算準財政撥款的各個項目，預算與醫院戰略目標聯系不緊密。
第二，只編院級、無科級預算，預算科目不明細且缺乏正確性，缺乏對預算的執行控制和分析評估。部分醫院的財務預算流于形式，預算更多地表現為簡單的計劃與控制，缺乏必要的事前論證和事后評價過程，缺乏對經濟行為的導向作用。
第三，醫院財務預算的編制方法和過程不科學，預算編制基本上是由領導和財務部分依據上年決算數據推算而成，預算編制的內容在實踐中沒有起到應有的控制作用。醫院財務預算對醫院的無形資產和固定資產缺乏經濟效益分析與評價，使得財務預算的主觀性較大，同時在本錢核算、折舊核算方式、財務報表反映的內容上也存在著諸多缺陷。
三、完善醫院全面預算治理的策略
1、樹立全面預算治理戰略性地位的理念。全面預算治理是現代醫院戰略治理的重要形式，通過全面預算治理，可以同一經營理念，明確奮斗目標，激發治理的動力，增強治理的適應能力，確保醫院核心競爭力的提升，通過全面預算治理，可以指導和協助衛生監管部分評價和確定方案、費率和價格，確保向群眾提供高效、低廉的高質量的醫療服務，實現政府機構所要求達到的經營效果，因此，醫院及其監管部分都應通過全面預算治理來規劃醫院的未來發展，進步衛生資源利用效率。
2、建立分層次的全面預算治理組織。醫院可設立全面預算治理委員會，由院長及相關部分主任組成，負責設定和批準醫院及主要部分的預算目標，解決預算編制過程中可能出現的沖突和分歧，監控預算的實施并在預算期未評價經營效果，并審批預算期內對預算的重大調整。除全面預算治理委員會外，醫院還需要設置預算專職部分，一般由財務部分承擔，并直接隸屬于全面預算治理委員會，以確保預算機制的有效運行。在所有需要參加預算編制的科室，都應設置預算員，預算員對其所在科室負責，業務則受全面預算治理委員會及專職預算機構指導。
3、以全面預算為核心優化財務治理組織體系。以在全面預算治理職能組織上設立財務決策中心、會計核算中心、資產配置中心和內部審計中心。財務決策中心負責醫院財務治理工作，進行經營治理活動效益分析、研究和評價，為醫院最高決策層提供財務決策支持與建議；會計核算中心負責醫院會計核算全面工作，及時正確提供財務報表及報告；資產配置中心負責醫院投資、籌資活動及現有資產的治理工作，保證醫院資產實現高效配置；內部審計中心獨立于其他3個中心，直接接受院長領導，主要負責醫院內部審核、審計監視工作，并對醫院各部分預算進行審計。
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