藥品零售連鎖企業是我國醫藥零售產業發展的一種新的營銷方式和管理模式，它是我國市場經濟體制改革不斷深入完善的產物，在藥品零售市場中占據了主導地位，日益被社會所認同。跨地域連鎖企業如雨后春筍般蓬勃發展，展現出了無限生機。但是，在企業管理體系實際運行中，也逐漸顯現出不少缺陷及問題。
如跨地域連鎖網點延伸面廣，再加上機構、人員配置有限，在對所轄網點的指導和督導上實施不到位；對制度執行情況無法進行有效監控，出現了管理上的失控；另外受地域交通的限制，藥品統一配送也無法到位等。上述問題的存在，說明跨地域連鎖仍存在著某些缺陷。為提高藥品零售企業的整體管理水平，合理配置資源，作為一種探索，重慶市區于開始發展了一批區內藥品零售連鎖企業。經過發展現已形成基本格局：一是以藥品批發企業為依托組建的藥品連鎖，有基礎，有實力，管理較規范；二是零售藥品企業為擴大經營規模，經重組整合而組建的藥品連鎖，雖然基礎較差，規模小，但有發展潛力。
這種格局的形成，在一定程度上彌補了跨地域連鎖的局限性。作為一種連鎖形式，區內藥品連鎖企業在整頓和規范藥品流通秩序，有效防止假劣藥品進入流通領域中發揮了重要作用。一是有利于地方藥品監督管理部門加強對藥品流通環節的監管，大大提高了監督管理的集中度和有效性；
二是解決了跨地域連鎖企業在管理上的脫節和統一配送不到位的問題；三是規范了藥品市場流通體制的散、亂、差問題，通過優化組合，促進了藥品零售產業向規模化、集約化發展；四是為打造連鎖品牌企業、跨地域發展奠定了良好的基礎；五是連鎖企業網點的延伸，解決了農村邊遠地區農民吃藥難的問題。區內藥品零售連鎖企業因為起步較晚，其組織模式和管理方法還在不斷的探索和完善之中。
在發展過程中存在著許多問題，主要表現在：有的藥品連鎖企業一味追求上規模，大量收編加盟藥店，導致管理上的失控；有的藥品企業管理機構人員素質低下，經營管理上呈無序狀態；有的.藥品企業名為藥品連鎖，實則各干各的，根本未實行統一管理，統一配送；更有甚者，借“連鎖”之名，行“批發”之為。
上述種種問題的存在，嚴重阻礙了藥品零售連鎖經營企業的健康發展，亟待進一步規范：（一）藥品監督管理部門在堅持“以監督為中心，監幫促相結合”的工作方針的同時，把推進藥品零售連鎖與整頓規范藥品市場秩序結合起來，嚴把準入關，防止低水平地一哄而上，盲目發展。
（二）大力鼓勵和支持區內藥品零售連鎖經營的發展，特別是農村邊遠地區網點的建設，實行政策上的優先扶持，在其經營硬件的準入標準上適當放寬。
（三）加強對區內藥品零售藥品連鎖企業的動態管理和正確引導，對未實行“五統一”管理，藥品質量保證體系不健全，不認真實施gsp，質量管理水平滯后，規范發展上達不到要求的企業要堅決撤銷其資格，予以取締。為此，筆者認為，結合地方實際，合理布局，建立區內藥品零售藥品連鎖企業，是適應醫藥經營體制改革要求的藥品流通新格局的一種大膽探索，應得到大力支持和鼓勵。
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