國家執業藥師資格考試科目分為：
藥學類：
藥事管理與法規（藥學類、中藥學類共考科目）
藥學專業知識（一）含藥劑學、藥物化學、藥理學、藥物分析
藥學專業知識（二）含臨床藥物治療學、臨床藥理學
中藥學類：
藥事管理與法規（藥學類、中藥學類共考科目）
中藥學專業知識（一）含中藥學、中藥化學、中藥炮制學、中藥藥劑學、中藥藥理學、中藥鑒定學
中藥學專業知識（二）含臨床中藥學、中成藥學和方劑學
中藥學綜合知識與技能
各科單獨考試，單獨計分，2016年執業藥師每科試卷滿分為120分。
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