大部分的就業單位是中央或者地方隸屬的水產研究所，如中國水產科學研究院、黑龍江水產研究所、黑龍江漁業經濟研究所等。飼料公司對技術方面更加感興趣的同學可以從事飼料的技術、研發工作，通過運用所學的專業知識，對水產養殖戶進行指導，使他們能更好地投喂飼料，降低餌料系數。該方面比較大的公司有山東六和集團、新希望集團、正虹集團等。水產公司學生了解水產養殖的專業知識，熟悉養殖動物的生活習性，可在這類公司從事技術開發或者管理生產的工作。此外，學生也可以在水產類院校從事教學或者教學管理等工作。
目前，國內很多高等院校開設了水產養殖方面的專業，但基于我國在水產養殖方面的實情，我國的水產業仍處于初級階段。因此，我國水產業需要很多擁有該專業知識的技術人員，甚至目前的養殖行業中出現了求大于供的現象。近年來，該專業本科生就業率達到90%以上，與其他專業相比，該專業的學生就業壓力相對較小。