二者不同
1.作用不同
從藥物副作用上來說，鹽酸氨糖中的氯離子對胃腸道有一定的刺激性，因此，鹽酸氨糖發生胃部不適副反應的幾率會更大，而硫酸氨糖相對胃腸道刺激小，但服用氨糖，都有可能出現胃痛、腹部不適、惡心等不良反應的發生。
2.形成過程不同
硫酸氨糖在形成過程中，往往需要氯化鈉等物質作為穩定性，因此，有些硫酸氨糖制劑中，往往還有較高的Na離子，對于鹽敏感性高血壓患者來說，過多的攝入Na離子，也是一種升高血壓的風險，但鹽酸氨糖則沒有這個方面的問題，但目前市面上也有一些脫去鈉離子或鉀離子的新式的硫酸氨糖產品，這類產品相對來說則安全性更高。
鹽酸氨糖
鹽酸氨糖一直在與硫酸氨糖進行對比，僅就作用來看，這兩者是沒有任何區別的。作用：鹽酸鹽和硫酸鹽都完全溶解于胃酸中，胃酸能使所有的氨基葡萄糖釋放出來以供小腸迅速吸收，而不管其來源，一旦氨基葡萄糖被吸收進血液，它就與最初的鹽無關，對身體的作用是相同的。