學(xué)校前身是教育家陶行知于1927年創(chuàng)辦的曉莊試驗鄉(xiāng)村師范；2000年3月，原南京師范專科學(xué)校、南京教育學(xué)院、南京市曉莊師范學(xué)校合并組建成為南京曉莊學(xué)院；2014年，南京幼兒高等師范學(xué)校并入。
截至2021年5月，學(xué)校共有方山、莫愁兩個校區(qū)，校園面積近1500畝；設(shè)有15個專業(yè)學(xué)院，47個本科招生專業(yè)；共有教職工1375人，全日制在籍本科學(xué)生18400余人。