學校的前身是1947年8月在河北省平山縣西柏坡開辦的中央工委青年干部訓練班，先后更名為南京機要學校、北京機要學校、宣化機要學校；1981年升格為北京電子專科學校；1992年，升格為北京電子科技學院。
據2019年6月學校官網顯示，學校占地140余畝，建筑面積7萬4千余平方米；設有4個系、2個教學部；開設9個本科專業；擁有1個一級學科碩士學位授權點，1個碩士專業學位授權點（包括2個領域），有全日制在校生2000余人。2003年教育部批準學院與西安電子科技大學開展聯合培養密碼學碩士學位研究生工作，2004年學院開始與西安電子科技大學聯合招收全國統考碩士學位研究生，2011年學院與西安電子科技大學簽訂了增補專業聯合培養碩士學位研究生協議，聯合培養學術性研究生學科在單一的密碼學基礎上增加了通信與信息系統、計算機應用技術兩個學科。