《采草藥》是闡明事理的說明文。作者的思路是先對傳統“古法”表示否定，然后從草藥使用的部位不同和草藥生長的條件不同兩個方面，正面說明自己的觀點。全文只一段，可分兩層：
第一層（“古法采草藥多用二月、八月，此殊未當。”）提出觀點。
第二層（“但二月草已芽……豈可一切拘以定月哉。”）說明觀點。
第一小層（“但二月草已芽……在藥則未為良時。”）指出古法二月、八月采草藥只是便于采集者辨識，就藥材說并不是最佳時間。作者以此作為第二層的開頭，承上啟下。
第二小層（“大率用根者……此人力之不同也。”）從兩方面詳細說明采草藥不能“一切拘以定月”。
這一小層分別從草藥使用的部位不同，采藥時間也應不同，以及草藥生長的條件不同，采藥時間也應不同兩方面來否定古法，闡明觀點。
關于使用部位不同方面（“大率用根者……皆不可限以時月”），作者依次說明“用根者”（又分“有宿根”者和“無宿根者”）“用葉者”、“用芽者”、“用花者”、“用實者”五種情況。作者根據草藥生長規律，指出采用部位不同，采藥的時間也應不同。
關于草藥生長的條件方面（“緣土氣有早晚……此人力之不同也。”）作者依次說明的是：“地勢”（海拔高低）、“物性”（植物品種不同）、“地氣”（緯度南北）和“人力”（栽培情況差別）這些生長條件不同，采藥的時間也應不同。
第三小層（“豈可一切拘以定月哉。”）總結。
從這個結構分析可以看出，本文的說明順序是闡明事理的說明文常用的邏輯順序，它不同于說明實體事物常用的空間順序或說明事物發展變化過程常用的時間順序。