相比其他專業，秘書專業畢業論文還存在選題范圍較窄、理論性不強等問題。在當前對本科專業是否需要撰寫畢業論文尚有爭議的情況下，對專科層次的秘書專業是否有必要進行畢業論文的寫作在認識上和實際操作中更是存在分歧。有些學校完全取消這一環節，從規范教學管理、提高辦學層次的目的出發，一些保留了專科層次畢業論文寫作環節的學校，在畢業論文寫作和答辯中也存在走過場的現象。由于秘書專業本身尚不成熟，學生在寫作畢業論文時理論儲備不足，論文雷同甚至抄襲的現象較多，秘書專業的畢業論文寫作環節成為秘書專業培養過程中需要突破的瓶頸。
筆者認為，作為對所學知識和理論進行梳理、整合，將在校期間所學綜合運用的一次實踐性練兵，畢業論文撰寫環節是必不可少的，且針對秘書這一對學生的寫作素質和能力均有較高要求的專業，畢業論文寫作更是其學業訓練、職業能力培養的一個重要組成部分。筆者所在學校已有二十余年的開設秘書專業的歷史，對畢業論文的環節要求嚴格，近幾年在畢業論文的指導中越來越突出的感覺到秘書專業畢業論文的指導需改進，尤其在三個方面要嚴格把關。
按論題的性質不同進行分類，畢業論文的論題可分為：真題真做，真題假作和假題真做三種類型。真題真做是指以來自實踐第一線的`尚待解決的實際問題作為畢業論文的選題，運用所學理論真刀實槍的演練，力求找到解決實際問題的方法。真題假作是指論文選題來源于實際，但做論文時可只在理論上加以解決，或者來源于實踐的論題已部分得到解決，學生運用所學理論和知識模擬解決實際問題，或可得出一個全新的結論。假題真做是指虛擬的題目，學生要對這一虛擬問題進行實際的演練，運用所學理論進行分析、論證，以求找到解決方法和途徑。
近年來由于擴招和就業壓力所致，不同層次不同專業學生的畢業論文質量均有下降，秘書專業也不例外。
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